CRC Handbook of Biochemistry and Molecular Biology

CRC 生物化学和分子生物学手册

作者:Gerald D. Fasman

出版:CRC Press

索书号:Q5/H236(3)/Sect.1.V.2/2018/ Y

ISBN: 978-1-315-89330-3

藏书地点:武大外教中心

半系统或琐碎名称的缩写通常由三个或四个大写字母组成,如何选择主要是为了简洁而不是系统作用。符号与缩写的区别在于它们代表较大分子的特定部分,就像元素符号用于描述分子一样,因此在构造和使用上相当系统。物体与其镜像的非同一性的特性称为手性。由等摩尔量的对映体分子组成的均匀固相称为外消旋化合物。作为单独固相存在的等摩尔量的对映体分子的混合物被称为外消旋混合物。分子间环状缩醛,由两个单糖分子缩合形成,同时消除两个水分子。

糖脂可分为鞘糖脂和甘油糖脂,这取决于它们是否含有N-酰基鞘氨醇或甘油二酯作为苷元。鞘糖脂的分类可以是中性鞘糖脂、硫苷脂和神经节苷脂,这取决于硫酸盐和唾液酸的存在与否,或者一系列不同的寡糖名称加上糖脂中糖链的主链结构。这些结构的符号应通过表示这些分类,加上表示碳水化合物残基数量的阿拉伯数字和表示位置异构体的字母来表示。各种单糖和双糖的X-Ray晶体结构数据已经汇编,并且计算糖单元的键长和键角的加权平均值。仅报告了计算的键长和键角的值,并没有试图得出任何结论。

根据皮脂腺脂质的薄层色谱数据和未发表的数据计算得出。值是典型值而不是平均值,并且经常来自特定样本的特定分析。可能会发生极端变化,这取决于许多变量,例如脂肪或油的来源、处理方法和年龄。除非另有说明,否则比重是在指定温度下计算的,并指相同温度下的水。括号中显示的密度是在指定温度下测量的。所有银离子薄层色谱分离和臭氧分解反应均一式两份进行。主要包括甘油三酯,但也包括游离胆固醇和游离脂肪酸。

天冬酰胺的脱酰胺作用与异天冬氨酸的形成和肽键裂是生物制药蛋白产品异质性的最常见原因之一。天冬酰胺的脱酰胺过程包括形成环琥珀酰亚胺,它分解形成天冬氨酸或异天冬氨酸。脱酰胺作用导致蛋白质的异质性,从而导致效价的损失。影响天门冬酰胺残基脱酰胺作用的因素包括天门冬酰胺残基周围的氨基酸序列、pH值、缓冲液组成和温度。一般来说,蛋白质中的天冬酰胺对脱酰胺作用的敏感性低于肽。谷氨酰胺也易受脱酰胺作用的影响。

这种研究需要直接测量沉降系数S;扩散系数D;由这三个值可以计算出分子量M和摩擦系数f/f 0。后者是一个比率,表示沉降分子遇到的阻力,相对于一个光滑的球形粒子相同的重量和密度。对于有序固体,多肽和蛋白质构象敏感红外吸收带的偏振特性。在常用的岩盐光谱区域,有两个这样的波段,一个在1650±40 cm−1,另一个在1530±30 cm−1。这些带的精确频率和极化(对于有序固体)取决于样品的二级结构(构象)。表1列出了无序固体和固体中五种不同有序构象的计算频率。请注意,每个构象产生每个带的多个组分,但其中一些预测的组分非常弱。相对于链传播方向,极化是平行的(‖)或垂直的()

虽然蛋白酶抑制剂混合物已经使用了一段时间,但很少有严格的研究检查它们对蛋白质水解的影响,也很少有研究涉及分析材料加工或纯化过程中的蛋白质水解降解通常认为,蛋白质水解可能是一个问题,蛋白酶抑制剂或蛋白酶抑制剂混合物通常包括作为协议的一部分。SalvesonNagase3详细讨论了蛋白水解酶的抑制,包括许多在实验设计中应该考虑的实际信息。抑制剂浓度、抑制剂/酶结合常数(缔合常数、结合常数、t1/2、抑制常数等)与酶抑制之间的关系尤为重要。例如,对于可逆的酶抑制剂(如苯甲脒),如果Ki值为100 nM,则需要100 μ M浓度的抑制剂来降低99.9%的蛋白酶活性。SalvesonNagase3还注意到抑制剂如DFPPMSF与丝氨酸蛋白酶活性位点的反应速率的众所周知的差异。在胰酶作用下,DFPPMSF快得多,但在胰凝乳酶作用下,DFP的速度与PMSF相当。与DFP相比,PMSF没有毒性,因此被包括在商业蛋白酶抑制剂混合物中;3, 4-二氯异香豆素(3,4 - dci),正如Powers和同事所描述的,4DFPPMSF都要快。酶抑制也发生在底物(蛋白质)的存在,这将影响不可逆和可逆酶抑制剂的有效性。此外,一些蛋白酶抑制剂混合物包括PMSF和苯甲脒。苯甲脒的竞争性抑制剂丝氨酸蛋白酶,减缓这种酶的失活率等试剂PMSF.5。也建议考虑修改蛋白质和其他生物蛋白酶抑制剂化合物的反应与蛋白酶变性。此外,一些蛋白酶抑制剂如DFPPMSF在用于变性的pH≥7.0条件下会发生水解。对于那些不熟悉DFP病史的人来说,DFP是一种有效的神经毒素(乙酰胆碱酯酶抑制剂),应该谨慎治疗;谨慎的研究者有一个近距离的DFP修复试剂盒(弱碱和普拉利多肟-2-[2-PAM])。考虑到这些不同的问题,验证样品是否受到蛋白质水解的保护是至关重要的。

CRC 生物化学和分子生物学手册》一书于2018年由CRC Press出版,作者是Gerald D. Fasman

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本书目录:

1 命名法

2 碳水化合物

3 脂质

4 类固醇

 

 

林岚 武汉大学生命科学学院 博士研究生