基因网络合成-建模,分析,稳健设计方法

-----Synthetic Gene Netwotk:Modeling,Analysis,and Robust Design Methods

 

作者:  Bor-sen Chen and Yu-Chao Wang

出版:  CRC Press Inc.

索书号:Q78/C518/2014/Y

ISBN:   978-1-466-59269-8

藏书地点: 武大外教中心

 

基因网络合成属于生物信息学中的一个重要的研究方法,生物信息学是研究生物信息的采集、处理、存储、传播,分析和解释等各方面的学科,也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展,生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。它通过综合利用生物学,计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。其研究重点主要体现在基因组学和蛋白质组学两方面,具体说就是从核酸和蛋白质序列出发,分析序列中表达的结构功能的生物信息。

合成生物学是基于分子生物学模拟哺乳动物细胞发挥功能的一门学科。在过去几十年的发展中,在设计生物学并将它们组装到基因循环通路中去行使功能方面取得了巨大的进步。最近合成生物学主要集中在生物学体系的合理设计。这种可以预测的人工的设计的生物学系统模拟真实的细胞行使功能需要建模、系统分析、设计以及实验技术的合作才能完成。合成生物学的建模需要一个人去设计基因网络以及他所预期的结果,之后用实验结果的定性和定量的结果与设计的模型比对,看是否相符。这就是合成生物学的大致步骤。

《基因网络合成-建模,分析,稳健设计方法》一书是2014年由Bor-sen Chen and Yu-Chao Wang编著,CRC Press Inc.出版社出版的关于基因网路合成的专业书籍。

《基因网络合成-建模,分析,稳健设计方法》一书讲述的是一种理性的设计,以及组成一种基因网络所需要的系统的方法。为了实现这个目标,首先在注册表中列出标准生物学部分和实验技术。然后这些生物组件具有一个标准的建模方法,然后被收录在组建文库中,这些都是在基因网络合成中经常用到的方法。基于系统理论,一些设计规范在有专门的网络连接,提供给专业的设计工程师。

《基因网络合成-建模,分析,稳健设计方法》一书的主要内容有数学模型和详细的基因网络合成设计、健全的生物合成设计基于系统的动态模型、健全的生物合成设计基于进化网络模型、启动子的结构和基因网络合成的启动子-RBS文库、健全的生物合成设计基于文库检索方法 、健全的生物合成筛选和晶体管设计基于启动子-RBS文库、合成基因网络中所有成员的通讯和同步 。

基因网络合成-建模,分析,稳健设计方法》一书作为基因网络合成的专业研究读物,思路清晰,观点新颖,内容丰富,除此之外,还包括一些其他的特点:

1、  作者在第一章首先对本书的主要内容作了主要的概括介绍,具体详细的将后面七章的主要内容做了概括,这使读者在本书开始就对整本书做了大致的了解。

2、  本书在最后附加了大量生动形象的图片,包括解释实验流程的彩色示意图,以及真实的实验操作照片,同时还有简单明白的模型图。形象生动的各种示意图,加上作者使用的通俗易懂的语言表达,大大降低了阅读的难度。

3、在本书的开始,作者将索引文献一一清晰列出,证明了这本书的知识性,真实性。而且,这些索引文献绝大部分都是最新研究,这就是这本书与世界最新研究同步,让读者全面了解该领域的前沿进展。

4、本书还具有很强的专业性,书中的每个章节都是由不同的专业研究人士提供,他们都是致力于该领域的最新研究,让我们在短时间内了解更全面,更专业的资料。

5、本书最多的是一些复杂的生物信息学公式,这就需要具备专业训练的科研人员阅读,因此本书是一本关于基因网络合成的书籍。建议没有生物信息学基础的读者,先要实现了解一些生物信息学的知识之后,再选择阅读这本书。

6、在本书的最后,将出现的专业词汇都罗列出来,并且按照英文字母表的顺序排列,并予以注解,大大方便了大家对阅读过程中对基因合成网络中的专业术语的认知。

总的说来,基因网络合成-建模,分析,稳健设计方法作为基因网络合成领域的一本专业图书,有很详细的基因网路构建方法。是一本值得为想要涉足该领域的人员推荐的专业书籍。

 

本书目录:

前言

第一章  简介 

第二章  数学模型和详细的基因网络合成设计

第三章  健全的生物合成设计基于系统的动态模型

第四章  健全的生物合成设计基于进化网络模型  

第五章  启动子的结构和基因网络合成的启动子-RBS文库  

第六章  健全的生物合成设计基于文库检索方法

第七章  健全的生物合成筛选和晶体管设计基于启动子-RBS文库

第八章  合成基因网络中所有成员的通讯和同步

索引

 

 

(武汉大学生命科学学院研究生  张英)